Isabela é a maior ilha do arquipélago e ocupa cerca de 60% de toda a área terrestre de Galápagos. Foi formada pelos vulcões Cerro Azul, Sierra Negra (Santa Tomás), Alcedo, Darwin, Wolf e Equador que se confinaram a uma ilha. Todos excepto o Vulcão Equador, que é mais antigo, ainda estão activos hoje em dia. Apesar de Isabela ter vários locais de visita, não é muito frequentada por turistas.

A maioria dos locais de desembarque encontram-se na costa ocidental e apenas barcos mais rápidos fazem esta longa viagem. O pequeno porto de Puerto Villamil (cerca de 3.000 habitantes) é o principal povoado da ilha. Existe também um pequeno aeroporto. Esta cidade é uma boa base se se pretende ficar mais tempo em Isabela. A área oferece belas praias e são necessários 20 minutos de caminhada para chegar à Laguna de Villamil, um dos locais preferidos dos observadores de aves nas ilhas. Flamingos podem ser vistos aqui, bem como cerca de vinte tipos diferentes de aves pernaltas.

Se gosta de montanhas, também pode subir o vulcão Sierra Negra (1,490m) desde Puerto Villamil. Uma carrinha leva-o até à aldeia Santo Tomás (20 km) e de lá pode caminhar ou subir a cavalo até à borda do vulcão (9 km). No topo, tem uma vista magnífica sobre a caldeira de 10 km de largura. Há uma trilha que o leva a alguns fumarolas activos. Esta área é o lar de corujas de orelhas curtas, tentilhões, gaviões e falcões de Galápagos.

O Muro de las Lágrimas é um local de visita a oeste de Puerto Villamil. Este muro de las Lágrimas foi construído em condições duras e abusivas por condenados (8 m de altura, 200 m de comprimento). A colónia penal foi encerrada em 1959, mas a muralha continua a ser um monumento a este capítulo infame da história das ilhas. Hoje é um bom local para observar de perto os lagartos de lava e vigiar as aves, especialmente os finches e falcões das Galápagos.

Os seguintes locais só podem ser visitados por barco:

Na costa sul ocidental, Punta Moreno está situada. Nas costas rochosas podem-se ver normalmente pinguins e uma grande variedade de pássaros costeiros (incluindo flamingos, se tiver sorte). Há um trilho que atravessa as rochas de lava. O Canal Bolívar entre as ilhas de Fernandina e Isabela é frequentemente frequentado por baleias. Por isso, talvez seja melhor procurar círculos de água suave – podem ser “pegadas” de baleias.

Em frente da Bahía Elisabeth (baía de Elizabeth) encontram-se as Ilhas Mariela, onde é frequentemente acolhido pelos pinguins. Esta baía é conhecida pela sua variedade de vida submarina. Os mergulhadores encontram tartarugas e arraias marinhas. Mas como a água é muito clara, também se pode observá-las a partir de uma panga (bote). A linha costeira está coberta de mangais que são o lar de aves e garças marinhas.

A baía de Urbina está localizada na base do Volcán Alcedo. Em 1954 houve uma elevação que elevou a linha costeira de repente até 1 km até ao mar. Um trilho leva-o a um recife de coral que se encontra agora em terra firme. Este é um bom local para ver corvos-marinhos sem voo, iguanas marinhas e pelicanos.

Mais a norte, a enseada do Tejo está localizada. Um passeio de panga (bote) ao longo da costa oferece, ao lado de uma variedade de aves marinhas, graffitis históricos. No passado, era um ancoradouro favorito e os marinheiros arranharam os nomes das suas embarcações nas falésias. O trilho turístico passa pela Laguna Darwin. uma lagoa de água salgada, e leva-o a várias formações de lava e a um cume com uma vista espectacular.

No ponto mais a norte da Ilha Isabela encontra-se Punto Albermarle; esta foi outrora uma base de radar dos EUA. Hoje é conhecido por corvo-marinho sem voo que pode ser observado a partir do seu barco (sem local de aterragem/visitante). Um bom local para mergulhar é nas proximidades de Punta Vicente Roca, na base do Vulcão Equador.